针对您提出的‘逮捕后已经三个因证据不足还在羁押中’的问题，若证据持续不足，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，羁押期限并非无限延长。若案件进入审判阶段，法院可能因证据不足做出无罪判决，从而结束羁押。若案件仍在检察院阶段，检察院可能会退回公安机关补充侦查，但补充侦查的次数和期限也是有限的。因此，羁押期限会因证据情况的变化而有所调整。
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在不同阶段，证据不足时的处理方式有：若在审判阶段，法院会做出无罪判决；若在检察院阶段，检察院会退回公安机关补充侦查。此外，在整个过程中，若羁押期限届满，案件仍未查清，也可能需要变更强制措施。
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从法律角度，应保障被羁押人的合法权益，包括：确保其享有辩护权，有权委托律师进行辩护；保障其申诉、控告的权利，对羁押决定不服可提出申诉；同时，应遵守法定羁押期限，防止超期羁押；在证据不足时，应及时做出无罪判决或退回补充侦查，避免不当羁押。